Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTBP49356 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTBP49356 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTBP49356 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTBP49356 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTBP49356 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTBP49356 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTBP49356 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTBP49356 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTBP49356 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTBP49356 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTBP49356 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTBP49356 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms