Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK1P39086 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms