Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAEP38570 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAEP38570 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms