Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRBP28702 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRBP28702 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRBP28702 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRBP28702 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRBP28702 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRBP28702 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRBP28702 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRBP28702 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RXRBP28702 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RXRBP28702 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RXRBP28702 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRBP28702 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms