Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX2P28328 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX2P28328 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX2P28328 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX2P28328 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX2P28328 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX2P28328 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms