Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYF6P23409 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYF6P23409 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYF6P23409 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYF6P23409 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYF6P23409 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYF6P23409 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
MYF6P23409 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYF6P23409 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYF6P23409 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYF6P23409 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYF6P23409 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms