Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB6P18564 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms