Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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