Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms