Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QRK9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QRK9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QRK9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
J3QRK9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
J3QRK9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
J3QRK9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
J3QRK9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
J3QRK9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
J3QRK9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QRK9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms