Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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