Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms