Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB11Q9Y547 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms