Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms