Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL20Q9Y2M5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms