Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms