Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms