Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms