Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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COPS7AQ9UBW8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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