Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ89

C12orf4, Protein C12orf4, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf4Q9NQ89 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf4Q9NQ89 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf4Q9NQ89 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf4Q9NQ89 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf4Q9NQ89 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms