Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM5Q9C035 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms