Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD1Q9BUP0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms