Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms