Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUDCD1Q96RS6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NUDCD1Q96RS6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms