Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms