Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms