Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELBQ8NG08 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms