Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms