Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC2Q8N158 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms