Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms