Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms