Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINGO4Q6UY18 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms