Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms