Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms