Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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