Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms