Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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