Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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