Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms