Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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TRAF3Q13114 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TRAF3Q13114 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TRAF3Q13114 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TRAF3Q13114 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TRAF3Q13114 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TRAF3Q13114 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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