Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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