Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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