Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX1P48742 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms