Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms