Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms