Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA3P42263 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA3P42263 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms