Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms