Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORAP35398 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORAP35398 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORAP35398 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RORAP35398 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORAP35398 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORAP35398 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RORAP35398 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORAP35398 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORAP35398 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms