Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms