Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGCP20142 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGCP20142 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGCP20142 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGCP20142 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGCP20142 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGCP20142 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGCP20142 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms